第四師可克達拉市總醫院是由第四師醫院為牽頭醫院，師市18個團場醫院和3個衛生院為成員單位，按照緊密型醫共體模式組建，于2020年9月16日正式揭牌運行的新的醫療機構。通過人財物整體移交和統籌管理，目前總院已基本實現“一家人、一盤棋、一本賬”的一體化管理模式。

按照師市醫療衛生規劃，總醫院形成了以第四師醫院（伊寧市院區、可克達拉市院區）為龍頭，62團、72團、75團三個片區中心醫院為支撐，64、66、67、73團四個重點團場醫院為補充，一般團場醫院和衛生院為依托，連隊衛生室為基礎的“一院兩區三片四重點”醫療服務新格局和師、片、團、連分級管理醫防結合的四級聯動新機制。

總院以章程為統領，明確內部管理機構、管理制度、議事規則、辦事程序，決策機制和成員單位的權責利等，規范內部治理結構和權力運行規則。由四師醫院黨委代行總院黨委職能，執行黨委領導下的院長負責制。通過優化黨組織架構，建立5個基層黨委、3個機關黨總支和47個基層黨支部，形成管理層次清晰、管理目標明確、決策精準高效的黨組織總體架構。通過實行大部制改革，推行扁平化垂直管理，統一法定代表人。已形成“一套班子、一個法定代表人、一體化管理”機制。